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Coleta de amostras de solo para avaliação do microbioma

Coleta de amostras de solo para avaliação do microbioma em vinhedo de altitude em Campo Largo, Paraná

A coleta de amostras de solo foi realizada em um vinhedo comercial localizado no município de Campo Largo, Paraná, a aproximadamente 1.040 m de altitude, inserido em uma região de elevada aptidão para a viticultura de clima frio. A área experimental integra estudos sobre o efeito de diferentes estratégias de manejo da cobertura vegetal nas linhas e entrelinhas do vinhedo sobre a qualidade do solo, a saúde das plantas e a composição das comunidades microbianas associadas ao sistema radicular da videira.

A amostragem foi conduzida durante o período de dormência das plantas, quando o vinhedo apresentava cobertura permanente do solo formada por resíduos vegetais provenientes das plantas de cobertura manejadas ao longo do ciclo produtivo. Foram coletadas amostras de solo destinadas à caracterização do microbioma edáfico, com foco na diversidade e estrutura das comunidades de bactérias e fungos, utilizando técnicas de sequenciamento de nova geração (NGS), por meio da amplificação das regiões 16S rRNA para bactérias e ITS para fungos. Esses marcadores moleculares permitem identificar milhares de táxons microbianos presentes no solo, fornecendo uma visão abrangente da biodiversidade associada aos diferentes manejos do vinhedo.

As coletas foram realizadas de forma criteriosa para minimizar contaminações, empregando luvas descartáveis, recipientes esterilizados e ferramentas higienizadas entre as amostragens. O solo foi obtido na região da rizosfera e em áreas adjacentes às plantas, buscando representar adequadamente a comunidade microbiana associada às raízes da videira. Após a coleta, as amostras foram acondicionadas em recipientes apropriados, mantidas sob refrigeração e posteriormente encaminhadas ao laboratório para extração de DNA e análises metagenômicas.

Paralelamente à coleta destinada ao estudo do microbioma, foram obtidas amostras indeformadas de solo, para avaliação de atributos físicos, incluindo densidade do solo e estabilidade de agregados. A integração entre atributos físicos, químicos e biológicos possibilitará compreender de maneira mais abrangente os mecanismos pelos quais a diversificação de plantas de cobertura modifica o ambiente edáfico e influencia o funcionamento do ecossistema vitícola.